راوحت الاحكام التي اصدرها القضاء اللبناني بحق موقوفي ميليشيا «الجنوبي» بين المنع من العودة الى مناطقهم لفترة تمتد بين ستة اشهر و5 سنوات مع السجن من شهر حتى سنة. وهذه حال السواد الاعظم من العناصر الذين حوكموا وجاهياً. اما الذين حوكموا غيابياً فقد راوحت احكامهم بين 15 سنة اشغالاً شاقة والمؤبد والاعدام.
ولم يصدر اي حكم وجاهي بالاعدام، اما اقسى الاحكام فكانت لاميل نصر قائد قطاع جزين في الميليشيا الذي ادين باعطاء الاوامر بقصف مدينة صيدا بعد قتل اقاربه في مكمن نصب له. وكانت عقوبته الاشغال الشاقة المؤبدة. اما انطوان الحايك، جلاد معتقل الخيام المشهور، فقد حكم بالسجن عشر سنوات.