تعاقب على رئاسة هيئة السكك الحديدية بمصر منذ عام 1991 وحتى اليوم ستة رؤساء جميعهم تمت اقالتهم بسبب وقوع حوادث قطارات أو نشوب خلافات بينهم وبين وزراء النقل. وكانت أقل فترة رئاسة للهيئة شهرين وأكثرها خمس سنوات.
والرؤساء الستة هم: المهندس حسين حليم واقيل بسبب مجاملة محافظ البحيرة وإيقاف أحد القطارات في محطة دمنهور مجاملة له، ثم عبد السلام شعت واقيل بعد حادث العياط وسقوط قطارين والمهندس محمود مرعي واقيل بعد حادث كفر الدوار والمهندس طلعت خطاب واقيل بناء على طلبه والمهندس محمد ماجد مصطفى لخلافات له مع وزير النقل السابق ابراهيم الدميري والمهندس احمد الشريف والذي اقيل بعد حادث قطار الصعيد.