* قيل إن اسم مقديشو محرف عن كلمة «مقعد شاه» (أي كرسي الملك)، إشارة إلى المكان المفضل الذي اتخذه الحاكم الفارسي مقرا له عندما حكم الفارسيون المدينة في أوائل القرن السادس الهجري، ثم أصبح ينطقها الصوماليون بمقديشو.
* اختلف المؤرخون حول تحديد تاريخ تأسيس مدينة مقديشو، بعض الروايات تقول إنها شيدت في عهد الخليفة الأموي عبد الملك بن مروان، وبعض الروايات تشير إلى أن بناءها يرجع إلى ما قبل الميلاد.
* تتابع على حكم مقديشو عدد كبير من الدول والسلطنات، أسس بعضها المهاجرون العرب والفارسيون، والبعض الآخر كان تابعا للخلافة الإسلامية، كما كان بعض هذه الدول تابعا لسلطنات قبلية صومالية إضافة إلى الاحتلال البرتغالي والإيطالي. وأهم هذه الدول والسلطنات:
* دولة حمير: في عهد أسعد بن كرب أحد ملوك الدولة الحميرية في اليمن في القرن الرابع الميلادي.
* الدولة الأموية: في عهد الخليفة عبد الملك بن مروان.
* دولة حلوان: في أوائل القرن السادس الهجري، وحكمها حاكم من حكام حلوان من طرف محمد شاه المنسوب إلى ولاية حلوان في العراق.
* دولة زوزان: في أوائل النصف الثاني من القرن السادس الهجري بعد دولة حلوان.
* الدولة الشيرازية: في القرن السابع الهجري، وكانوا مشتهرين ببناء المساجد الضخمة في المدينة التي تحمل الطابع الفارسي في العمارة.
* دولة فخر الدين: أسسها السلطان أبو بكر فخر الدين في القرن الثالث عشر الميلادي وحتى منتصف القرن الرابع عشر الميلادي. وقد قام الرحالة العربي ابن بطوطة بزيارة مقديشو عام 1331م في عهد سلطان من هذه الأسرة هو السلطان أبو بكر شيخ عمر، كما ذكره ابن بطوطة في رحلته.
* البرتغاليون: وقد حكموا مقديشو لفترة قصيرة أخضعوها لحكمهم عام 1499.
* دولة المظفر: في أوائل القرن السادس عشر الميلادي.
* دولة ياقوب: وهي سلطنة صومالية من قبيلة أبجال، وقد حكمت مقديشو لفترة طويلة في القرن الثامن عشر الميلادي.
* الدولة العمانية: في عهد السلطان برغش العماني سلطان زنجبار الذي بسط نفوذه على ساحل أفريقيا الشرقية في النصف الثاني من القرن الثامن عشر الميلادي. وقد أصبحت مقديشو فعلا عام 1871م تابعة سياسيا للسلطان العماني في زنجبار .
* إيطاليا: التي احتلت المدينة عام 1892 بعد عقد أبرمته الحكومة الإيطالية مع السلطان العماني، تنازل بموجبه عن سواحل الصومال لصالح إيطاليا مقابل 140 ألف روبية سنويا.
* في بداية الخمسينات أصبحت مقديشو تتمتع بإدارة محلية صومالية بعد وضع الصومال تحت الوصاية الدولية في الفترة ما بين 1950 - 1960؛ حيث أصبحت عاصمة الصومال منذ الاستقلال في يونيو (حزيران) عام 1960.