قال الرئيس الإيراني محمود أحمدي نجاد إن بلاده تحترم سيادة واستقلال البحرين، وأن «أمن وعزة مملكة البحرين من أمن وعزة الجمهورية الإسلامية الإيرانية»، مضيفا أن العلاقة البحرينية - الإيرانية علاقة متميزة وتاريخية ووطيدة، وأنها قائمة على الاحترام المتبادل والاعتراف بالسيادة القانونية لكلا البلدين، وعدم التدخل في الشؤون الداخلية.
وخلال استقباله وفدا برلمانيا بحرينيا يزور طهران حاليا، رحب الرئيس الإيراني بدعوة الملك حمد بن عيسى آل خليفة ملك البحرين لزيارة إيران، معتبرا أن طهران بانتظار زيارته الأخوية الكريمة لها، مؤكدا أهمية تكثيف الزيارات المتبادلة على المستوى الرسمي والشعبي بين البلدين، وتعزيز العلاقات الأخوية ومد جسور التواصل والتعاون في كافة المجالات الحيوية.
وكانت العلاقات الخليجية - الإيرانية قد توترت ذات مرة، بسبب تصريحات إيرانية شبه رسمية تمس استقلال وسيادة البحرين وتشكك في هويتها العربية، فيما تتبرأ السلطات الرسمية الإيرانية من هذه التصريحات، التي أطلقها نواب ومستشارون للمرشد الأعلى علي خامنئي، حيث تعتبر الحكومة الإيرانية أن هذه المواقف التي تمس سيادة البحرين، لا تمثل الموقف الرسمي لطهران. وأعرب الرئيس الإيراني عن صادق مشاعره تجاه جميع المسلمين من سنة وشيعة وأنه لا فرق بينهما، وأن فتح الحوار والمصارحة سبيل أكيد لحل كافة الخلافات في المجتمع الإسلامي، وأكد على وقوف إيران وتضامنها مع قيادة البحرين في كافة القضايا. من جهته، طالب خليفة بن أحمد الظهراني رئيس مجلس النواب البحريني بأن تبادر دول المنطقة ومسؤولوها بسرعة إخماد أي فتنة وتكذيب الإشاعات وأهمية الرد والتوضيح على أي تصريح غير مسؤول من كلا الجانبين. كما دعا الظهراني لوحدة الصف الإسلامي والحذر من الفرقة الطائفية بين السنة والشيعة، وأكد على حكمة القيادة الإيرانية في النهج المعتدل واحترام كافة الأطياف الإسلامية «باعتبار الجمهورية الإسلامية الإيرانية خير عون لوحدة الدول الإسلامية في المنطقة، لما لها من مكانة وثقل واحترام في نفوس الجميع».